Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ecm2Q5FW85 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms