Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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