Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfmbt2Q5DTW2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfmbt2Q5DTW2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfmbt2Q5DTW2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfmbt2Q5DTW2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfmbt2Q5DTW2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfmbt2Q5DTW2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfmbt2Q5DTW2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfmbt2Q5DTW2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfmbt2Q5DTW2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfmbt2Q5DTW2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfmbt2Q5DTW2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfmbt2Q5DTW2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfmbt2Q5DTW2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfmbt2Q5DTW2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfmbt2Q5DTW2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfmbt2Q5DTW2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfmbt2Q5DTW2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfmbt2Q5DTW2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfmbt2Q5DTW2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfmbt2Q5DTW2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfmbt2Q5DTW2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfmbt2Q5DTW2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfmbt2Q5DTW2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfmbt2Q5DTW2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sfmbt2Q5DTW2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sfmbt2Q5DTW2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sfmbt2Q5DTW2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sfmbt2Q5DTW2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sfmbt2Q5DTW2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sfmbt2Q5DTW2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sfmbt2Q5DTW2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfmbt2Q5DTW2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms