Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Eme2Q56A04 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms