Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrig2Q52KR2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.8 ms