Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1qtnf9Q4ZJN1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1qtnf9Q4ZJN1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1qtnf9Q4ZJN1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1qtnf9Q4ZJN1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1qtnf9Q4ZJN1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1qtnf9Q4ZJN1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1qtnf9Q4ZJN1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1qtnf9Q4ZJN1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1qtnf9Q4ZJN1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1qtnf9Q4ZJN1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1qtnf9Q4ZJN1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1qtnf9Q4ZJN1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1qtnf9Q4ZJN1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1qtnf9Q4ZJN1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1qtnf9Q4ZJN1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1qtnf9Q4ZJN1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1qtnf9Q4ZJN1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1qtnf9Q4ZJN1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1qtnf9Q4ZJN1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1qtnf9Q4ZJN1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C1qtnf9Q4ZJN1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C1qtnf9Q4ZJN1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C1qtnf9Q4ZJN1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C1qtnf9Q4ZJN1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C1qtnf9Q4ZJN1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms