Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZGD9

Nxf3, Nuclear RNA export factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxf3Q4ZGD9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nxf3Q4ZGD9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nxf3Q4ZGD9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nxf3Q4ZGD9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nxf3Q4ZGD9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nxf3Q4ZGD9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf3Q4ZGD9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf3Q4ZGD9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf3Q4ZGD9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf3Q4ZGD9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf3Q4ZGD9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf3Q4ZGD9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf3Q4ZGD9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf3Q4ZGD9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf3Q4ZGD9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nxf3Q4ZGD9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nxf3Q4ZGD9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nxf3Q4ZGD9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nxf3Q4ZGD9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nxf3Q4ZGD9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nxf3Q4ZGD9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nxf3Q4ZGD9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxf3Q4ZGD9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nxf3Q4ZGD9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nxf3Q4ZGD9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxf3Q4ZGD9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxf3Q4ZGD9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxf3Q4ZGD9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxf3Q4ZGD9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms