Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Shank3Q4ACU6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shank3Q4ACU6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shank3Q4ACU6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms