Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxn3Q499D0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxn3Q499D0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms