Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Samd5Q3V1H9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms