Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ckap2Q3V1H1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ckap2Q3V1H1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms