Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ulk4Q3V129 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms