Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0T4

Itgad, Integrin alpha-D, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgadQ3V0T4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ItgadQ3V0T4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ItgadQ3V0T4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms