Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0I2

Prr7, Proline-rich protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr7Q3V0I2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prr7Q3V0I2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prr7Q3V0I2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prr7Q3V0I2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prr7Q3V0I2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prr7Q3V0I2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prr7Q3V0I2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prr7Q3V0I2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prr7Q3V0I2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prr7Q3V0I2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prr7Q3V0I2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prr7Q3V0I2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prr7Q3V0I2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prr7Q3V0I2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prr7Q3V0I2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prr7Q3V0I2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prr7Q3V0I2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prr7Q3V0I2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prr7Q3V0I2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms