Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms