Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV9

Ncbp1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp1Q3UYV9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncbp1Q3UYV9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ncbp1Q3UYV9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncbp1Q3UYV9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncbp1Q3UYV9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncbp1Q3UYV9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncbp1Q3UYV9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncbp1Q3UYV9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncbp1Q3UYV9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncbp1Q3UYV9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncbp1Q3UYV9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncbp1Q3UYV9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncbp1Q3UYV9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncbp1Q3UYV9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncbp1Q3UYV9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncbp1Q3UYV9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncbp1Q3UYV9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncbp1Q3UYV9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncbp1Q3UYV9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncbp1Q3UYV9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncbp1Q3UYV9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncbp1Q3UYV9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncbp1Q3UYV9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncbp1Q3UYV9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncbp1Q3UYV9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms