Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms