Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clpsl2Q3UW21 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clpsl2Q3UW21 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clpsl2Q3UW21 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clpsl2Q3UW21 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clpsl2Q3UW21 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clpsl2Q3UW21 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clpsl2Q3UW21 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clpsl2Q3UW21 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clpsl2Q3UW21 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clpsl2Q3UW21 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms