Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Obox3Q3UT54 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Obox3Q3UT54 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Obox3Q3UT54 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Obox3Q3UT54 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Obox3Q3UT54 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Obox3Q3UT54 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Obox3Q3UT54 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Obox3Q3UT54 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Obox3Q3UT54 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Obox3Q3UT54 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Obox3Q3UT54 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Obox3Q3UT54 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Obox3Q3UT54 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Obox3Q3UT54 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Obox3Q3UT54 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Obox3Q3UT54 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Obox3Q3UT54 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Obox3Q3UT54 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Obox3Q3UT54 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Obox3Q3UT54 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Obox3Q3UT54 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Obox3Q3UT54 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Obox3Q3UT54 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Obox3Q3UT54 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Obox3Q3UT54 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Obox3Q3UT54 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Obox3Q3UT54 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Obox3Q3UT54 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Obox3Q3UT54 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Obox3Q3UT54 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Obox3Q3UT54 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Obox3Q3UT54 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Obox3Q3UT54 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Obox3Q3UT54 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Obox3Q3UT54 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Obox3Q3UT54 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Obox3Q3UT54 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms