Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS3

Drc1, Dynein regulatory complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Drc1Q3USS3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Drc1Q3USS3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Drc1Q3USS3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Drc1Q3USS3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Drc1Q3USS3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Drc1Q3USS3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Drc1Q3USS3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Drc1Q3USS3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Drc1Q3USS3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Drc1Q3USS3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Drc1Q3USS3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Drc1Q3USS3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Drc1Q3USS3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Drc1Q3USS3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Drc1Q3USS3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Drc1Q3USS3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Drc1Q3USS3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Drc1Q3USS3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Drc1Q3USS3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Drc1Q3USS3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Drc1Q3USS3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Drc1Q3USS3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Drc1Q3USS3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Drc1Q3USS3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Drc1Q3USS3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Drc1Q3USS3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Drc1Q3USS3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Drc1Q3USS3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Drc1Q3USS3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Drc1Q3USS3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Drc1Q3USS3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Drc1Q3USS3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Drc1Q3USS3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Drc1Q3USS3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Drc1Q3USS3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Drc1Q3USS3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Drc1Q3USS3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms