Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fchsd2Q3USJ8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fchsd2Q3USJ8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fchsd2Q3USJ8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fchsd2Q3USJ8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fchsd2Q3USJ8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fchsd2Q3USJ8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fchsd2Q3USJ8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fchsd2Q3USJ8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fchsd2Q3USJ8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fchsd2Q3USJ8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fchsd2Q3USJ8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fchsd2Q3USJ8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fchsd2Q3USJ8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fchsd2Q3USJ8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fchsd2Q3USJ8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fchsd2Q3USJ8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fchsd2Q3USJ8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fchsd2Q3USJ8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fchsd2Q3USJ8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fchsd2Q3USJ8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fchsd2Q3USJ8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fchsd2Q3USJ8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fchsd2Q3USJ8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fchsd2Q3USJ8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fchsd2Q3USJ8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fchsd2Q3USJ8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fchsd2Q3USJ8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Fchsd2Q3USJ8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fchsd2Q3USJ8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fchsd2Q3USJ8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fchsd2Q3USJ8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fchsd2Q3USJ8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms