Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm28047Q3US59 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms