Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms