Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQI9

Mindy4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy4Q3UQI9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mindy4Q3UQI9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mindy4Q3UQI9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Mindy4Q3UQI9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mindy4Q3UQI9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mindy4Q3UQI9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mindy4Q3UQI9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mindy4Q3UQI9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mindy4Q3UQI9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mindy4Q3UQI9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mindy4Q3UQI9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mindy4Q3UQI9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mindy4Q3UQI9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mindy4Q3UQI9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mindy4Q3UQI9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mindy4Q3UQI9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mindy4Q3UQI9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mindy4Q3UQI9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mindy4Q3UQI9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mindy4Q3UQI9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mindy4Q3UQI9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mindy4Q3UQI9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mindy4Q3UQI9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mindy4Q3UQI9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms