Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms