Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms