Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q3UPC7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q3UPC7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q3UPC7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q3UPC7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q3UPC7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q3UPC7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q3UPC7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q3UPC7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q3UPC7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q3UPC7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q3UPC7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q3UPC7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q3UPC7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Q3UPC7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q3UPC7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q3UPC7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q3UPC7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Q3UPC7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q3UPC7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q3UPC7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q3UPC7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q3UPC7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q3UPC7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q3UPC7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Q3UPC7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3UPC7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q3UPC7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Q3UPC7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Q3UPC7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Q3UPC7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q3UPC7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q3UPC7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q3UPC7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3UPC7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3UPC7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3UPC7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3UPC7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3UPC7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3UPC7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3UPC7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3UPC7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3UPC7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3UPC7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3UPC7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q3UPC7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q3UPC7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q3UPC7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q3UPC7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q3UPC7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 327.7 ms