Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN02

Lclat1, Lysocardiolipin acyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lclat1Q3UN02 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lclat1Q3UN02 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lclat1Q3UN02 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lclat1Q3UN02 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lclat1Q3UN02 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lclat1Q3UN02 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lclat1Q3UN02 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lclat1Q3UN02 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lclat1Q3UN02 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lclat1Q3UN02 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lclat1Q3UN02 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lclat1Q3UN02 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lclat1Q3UN02 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lclat1Q3UN02 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lclat1Q3UN02 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lclat1Q3UN02 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lclat1Q3UN02 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lclat1Q3UN02 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lclat1Q3UN02 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lclat1Q3UN02 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lclat1Q3UN02 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lclat1Q3UN02 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lclat1Q3UN02 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lclat1Q3UN02 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lclat1Q3UN02 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lclat1Q3UN02 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lclat1Q3UN02 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lclat1Q3UN02 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lclat1Q3UN02 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lclat1Q3UN02 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lclat1Q3UN02 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lclat1Q3UN02 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lclat1Q3UN02 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lclat1Q3UN02 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lclat1Q3UN02 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lclat1Q3UN02 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lclat1Q3UN02 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lclat1Q3UN02 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms