Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cln5Q3UMW8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms