Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms