Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Edc4Q3UJB9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms