Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnep1r1Q3UJ81 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnep1r1Q3UJ81 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnep1r1Q3UJ81 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnep1r1Q3UJ81 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms