Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc177Q3UHB8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms