Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms