Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rsph3aQ3UFY4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms