Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Puf60Q3UEB3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Puf60Q3UEB3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Puf60Q3UEB3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Puf60Q3UEB3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Puf60Q3UEB3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Puf60Q3UEB3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Puf60Q3UEB3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Puf60Q3UEB3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Puf60Q3UEB3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Puf60Q3UEB3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Puf60Q3UEB3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Puf60Q3UEB3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Puf60Q3UEB3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Puf60Q3UEB3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Puf60Q3UEB3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Puf60Q3UEB3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Puf60Q3UEB3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Puf60Q3UEB3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Puf60Q3UEB3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Puf60Q3UEB3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Puf60Q3UEB3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Puf60Q3UEB3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Puf60Q3UEB3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Puf60Q3UEB3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Puf60Q3UEB3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Puf60Q3UEB3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Puf60Q3UEB3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Puf60Q3UEB3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Puf60Q3UEB3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Puf60Q3UEB3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Puf60Q3UEB3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Puf60Q3UEB3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms