Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Yipf3Q3UDR8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Yipf3Q3UDR8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms