Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3U6N9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3U6N9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3U6N9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3U6N9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q3U6N9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q3U6N9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q3U6N9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q3U6N9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q3U6N9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Q3U6N9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms