Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VwceQ3U515 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms