Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms