Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gse1Q3U3C9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gse1Q3U3C9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gse1Q3U3C9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gse1Q3U3C9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gse1Q3U3C9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gse1Q3U3C9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gse1Q3U3C9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gse1Q3U3C9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gse1Q3U3C9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gse1Q3U3C9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gse1Q3U3C9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gse1Q3U3C9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gse1Q3U3C9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gse1Q3U3C9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gse1Q3U3C9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gse1Q3U3C9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gse1Q3U3C9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gse1Q3U3C9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gse1Q3U3C9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gse1Q3U3C9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gse1Q3U3C9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gse1Q3U3C9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gse1Q3U3C9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gse1Q3U3C9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gse1Q3U3C9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gse1Q3U3C9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gse1Q3U3C9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gse1Q3U3C9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gse1Q3U3C9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gse1Q3U3C9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gse1Q3U3C9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gse1Q3U3C9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gse1Q3U3C9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gse1Q3U3C9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gse1Q3U3C9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gse1Q3U3C9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gse1Q3U3C9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms