Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Palb2Q3U0P1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms