Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYP4

Tmem88b, Transmembrane protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88bQ3TYP4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms