Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYD6

Lmtk2, Serine/threonine-protein kinase LMTK2, mousemouse

Predictions only

Length 1,471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmtk2Q3TYD6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lmtk2Q3TYD6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lmtk2Q3TYD6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lmtk2Q3TYD6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lmtk2Q3TYD6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lmtk2Q3TYD6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lmtk2Q3TYD6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lmtk2Q3TYD6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lmtk2Q3TYD6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lmtk2Q3TYD6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lmtk2Q3TYD6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lmtk2Q3TYD6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lmtk2Q3TYD6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lmtk2Q3TYD6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lmtk2Q3TYD6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lmtk2Q3TYD6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lmtk2Q3TYD6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lmtk2Q3TYD6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lmtk2Q3TYD6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lmtk2Q3TYD6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lmtk2Q3TYD6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Lmtk2Q3TYD6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lmtk2Q3TYD6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lmtk2Q3TYD6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lmtk2Q3TYD6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lmtk2Q3TYD6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lmtk2Q3TYD6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Lmtk2Q3TYD6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lmtk2Q3TYD6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lmtk2Q3TYD6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lmtk2Q3TYD6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lmtk2Q3TYD6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Lmtk2Q3TYD6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lmtk2Q3TYD6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lmtk2Q3TYD6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lmtk2Q3TYD6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lmtk2Q3TYD6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lmtk2Q3TYD6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lmtk2Q3TYD6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lmtk2Q3TYD6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lmtk2Q3TYD6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lmtk2Q3TYD6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lmtk2Q3TYD6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lmtk2Q3TYD6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lmtk2Q3TYD6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lmtk2Q3TYD6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lmtk2Q3TYD6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lmtk2Q3TYD6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lmtk2Q3TYD6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lmtk2Q3TYD6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lmtk2Q3TYD6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lmtk2Q3TYD6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Lmtk2Q3TYD6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lmtk2Q3TYD6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lmtk2Q3TYD6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lmtk2Q3TYD6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lmtk2Q3TYD6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Lmtk2Q3TYD6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
Lmtk2Q3TYD6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lmtk2Q3TYD6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lmtk2Q3TYD6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms