Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX08

Trmt1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1Q3TX08 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trmt1Q3TX08 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trmt1Q3TX08 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trmt1Q3TX08 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trmt1Q3TX08 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trmt1Q3TX08 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trmt1Q3TX08 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trmt1Q3TX08 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trmt1Q3TX08 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trmt1Q3TX08 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trmt1Q3TX08 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trmt1Q3TX08 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt1Q3TX08 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt1Q3TX08 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt1Q3TX08 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt1Q3TX08 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt1Q3TX08 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trmt1Q3TX08 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trmt1Q3TX08 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trmt1Q3TX08 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trmt1Q3TX08 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trmt1Q3TX08 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trmt1Q3TX08 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trmt1Q3TX08 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trmt1Q3TX08 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trmt1Q3TX08 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trmt1Q3TX08 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trmt1Q3TX08 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trmt1Q3TX08 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt1Q3TX08 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt1Q3TX08 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt1Q3TX08 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt1Q3TX08 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt1Q3TX08 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt1Q3TX08 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt1Q3TX08 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt1Q3TX08 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt1Q3TX08 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms