Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms