Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XylbQ3TNA1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms