Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrx1Q3TL44 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms