Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdlim7Q3TJD7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms