Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc13Q3TIR1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms